O Projeto

SIGTAP-2-OMOP

Sprint 01

  • Período: 08/Jun/2022 - 28/Jun/2022
  • Objetivos:
    • Engajar a comunidade a participar do projeto de mapeamento
  • Resultados:
    • 117 participantes inscritos
    • 80 participantes entraram no grupo de WhatsApp
  • Análise:
    • Consideramos que tivemos um sucesso no número de inscritos, demonstrando o interesse da comunidade em projetos abertos.
    • Temos como desafio manter o engajamento da comunidade nas etapas seguintes do projeto e envolvimento na organização do projeto.
  • Download da Apresentação da Reunião

Sprint 02

  • Período: 04/Jul/2022 - 15/Jul/2022
  • Objetivos:
    • Familiarizar os participantes com a ferramenta Usagi
    • Mapear 356 itens do Grupo “06 - Medicamentos” da “Tabela de Procedimentos, Medicamentos e OPM dos SUS - (SIGTAP)” para o domínio Drug do OMOP-CDM
  • Resultados:
    • 120 participantes receberam termos para mapear. Tivemos retorno de 21 participantes
    • Desse total, 18 enviaram arquivo em formato correto (“File” → “Save”). 3 participantes enviaram arquivo em formato que não pode ser aproveitado (“Export for review”).
    • Todos participantes receberam 10 termos iguais para podermos fazer uma análise inicial de entendimento do processo.
    • Tivemos 2 termos que foram mapeados por pelo menos 3 participantes.
    • Maioria dos participantes (76,2%) considerou o mapeamento um processo de dificuldade média.
    • Muitos participantes indicaram falhas grosseiras no processo de tradução que havíamos implementado (utilização da função GoogleTranslate do GoogleSheets)
  • Análise:
    • Necessidade de alinhar o processo de envio do .csv (todos enviarem no formato “File” → “Save”)
    • Necessidade de aprimorar o processo de tradução de termos
    • Necessidade de alinhamento conceitual dos processos de equivalência
  • Download da Apresentação da Reunião

Sprint 03

  • Período: 27/Jul/2022 - 24/Ago/2022
  • Objetivos:
    • Finalizar o mapeamento do domínio “Drugs”
  • Resultados:
    • 42 participantes receberam termos para mapear. Tivemos retorno de 23 participantes
    • 2 arquivos vieram em formato incorreto
    • Conseguimos mapear todos os 356 termos por pelo menos 3 participantes
    • Participantes consideraram o mapeamento nessa rodada mais fácil, sendo compatível com o processo da curva de aprendizado.
  • Análise:
    • Necessidade de tornar a governança mais descentralizada, escalável e transparente. Ajustaremos nosso processo de upload, download, versionamento e agreement para ferramenta do script Zelador utilizando Dolthub e script em .R
  • Download da Apresentação da Reunião

Sprint 04

  • Período: 05/Set -
  • Objetivos:
    • Familiarizar os participantes com o script Zelador e ferramenta Dolthub
    • Mapear os 282 termos cirúrgicos que correspondem por 95% do repasse do SUS. São termos pertencentes ao Grupo “04 - Procedimentos Cirúrgicos” da “Tabela de Procedimentos, Medicamentos e OPM dos SUS (SIGTAP)” e serão mapeados para domínio “Procedure” dos vocabulários padronizados do OMOP CDM
  • Resultados:
    • 181 linhas mapeadas no período
    • 8 participantes mapearam linhas
    • 2 participantes reservaram linhas mas não mapearam
  • Análise:
    • Redução na participação do grupo devido a incorporação de um novo processo
    • Orientação em relação as dúvidas relativas ao script Zelador
    • Atualmente utilizamos como default para mapeamento o termo com maior similaridade no Usagi. Passaremos a utilizar o termo mapeado em 2018 (caso existente) pois entendemos que boa parte dos termos de 2018 já apresentam bom mapeamento e que o processo atual já permite que seja feito essa mudança sendo possível atribuir o consenso ao grupo e não como decisões individuais.